plinkのインストール｜OS X ElCapitan (10.11.6)

plinkとは？

GWAS解析やQTL解析などに使える便利ツール。

HW平衡からの逸脱や、連鎖不平衡の解析もやってくれるとか。

詳しくはこれから勉強するところ。

インストール

とても簡単。ダウンロードして、解凍して、パスを通すだけ。

PLINK: Whole genome data analysis toolset

ここからmac用をダウンロード

今回はplink-1.07-mac-intel.zip

これを好きなところに解凍する

自分の場合はここ↓

~/Analysis/plink-1.07-mac-intel

このディレクトリにパスを通せば完了

cd
nano .bash_profile

で、以下の一文を追加

PATH=${PATH}:"/Users/〇〇/Analysis/plink-1.07-mac-intel"

※〇〇にはusernameが入る

で、保存して再ログイン

これでターミナル上でplinkコマンドが使えるようになる